O aeroporto de Sarajevo utiliza apenas um terminal comum a todas as partidas. À primeira vista, o aeroporto parece moderno, mas o seu serviço e limpeza ficam aquém de aeroportos de dimensão semelhante.
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Os balcões de check-in e a área de chegadas estão localizados no rés do chão. A segurança está localizada no primeiro andar, com escadas rolantes e elevadores que levam ao primeiro andar. Um rápido controlo de passaportes aguarda-o após a segurança.
A zona de trânsito contém 6 portas de embarque, duas das quais têm pontes de embarque directas para o avião, sendo as restantes transportadas de autocarro até ao avião.
Transferências entre voos
O aeroporto de Sarajevo não é um centro de transferência típico e não há transferência direta através da zona de trânsito.
No caso de uma transferência, é necessário passar pelo controlo de passaportes, sair da zona de trânsito e passar novamente pelo controlo de segurança e de passaportes para regressar aos aviões.